5 Batalion Saperów sformowany został w 1944. Jednostka podlegała 4 Pomorskiej Dywizji Piechoty do 1962. Następnie 4 Pomorskiej Dywizji Zmechanizowanej do 1990, a później 5 Kresowej Dywizji Pancernej do 1999. Następnie 4 Lubuskiej Dywizji Zmechanizowanej do 2001 i 11 Lubuskiej Dywizji Kawalerii Pancernej do 2011. Ostatecznie podlega 17 Wielkopolskiej Brygadzie Zmechanizowanej do chwili obecnej. Nazwę wyróżniającą "Kresowy" jednostka otrzymała w 1994 r decyzją nr 75/MON ministra obrony narodowej z dnia 4 sierpnia 1994.
Proporczyk wprowadzony decyzją nr 425/MON Ministra Obrony Narodowej z dnia 27 grudnia 2005 r.
http://g.ekspert.infor.pl/p/dane/aktypdf/U23/2005/24/232.pdf#zoom=90
